Визуализация бинарных данных

Вводные.
Есть два бинарных файла, содержащие данные сигналов.
Один - эталонный, второй для сравнения.
Сигналы периодические. В каждом периоде есть так называемая маска, стартовый набор импульсов.
Эта маска - константа. Таких периодов несколько, следующих друг за другом. Содержание после маски меняется.
Задача - выделить из сигнала по маске такие периоды и сравнить с эталоном начиная с первого периода.
То есть, нужно сравнить содержимое каждого периода с эталонными. 
Визуализация.
Допустим, в эталонном сигнале 25 периодов. Изобразить поле 25 пронумерованных квадратов, 5X5. После процесса сравнения выясняется, 
что в сравниваемом сигнале 25 периодов и содержание некоторых отличается от эталонного. Совпадающие периоды
обозначить квадратами одного цвета, несовпадающие - другим цветом.

Длительность периода может быть в пределах десятков и сотен микросекунд. 
Длительность самого короткого импульса единицы микросекунд.
На начальном этапе мне нужно знать, можно ли это реализовать?

Подробности при положительном первом этапе.